因涉嫌在生产蜂蜜过程中掺假等问题，国家食品药品监督管理总局对南昌高新区恒巢源生物科技厂发出安全警示函。针对查出的问题，江西省食药监局已责成公司停产整顿，并要求南昌市食品药品监督管理局针对检查中发现的涉嫌在生产过程中蜂蜜掺假等违法违规问题进一步调查。
据了解，2016年9月20日下午和9月22日，国家食品药品监督管理总局与江西省食品药品监督管理局组织相关监管人员与专家组成检查组，依据相关国家规定和标准对南昌高新区恒巢源生物科技厂开展了监督检查。检查中发现，该公司未能提供完整的蜂蜜原料进货财务账目和蜂蜜原料进货记录，无法对公司蜂蜜原料的进货量进行有效统计；未能提供成品蜂蜜生产记录以及完整的销售记录，也无法对该公司成品蜂蜜的生产量进行有效统计。
检查组称，在该公司生产记录严重不完整的情况下，无法通过物料平衡判断其公司是否在生产蜂蜜过程中掺入糖浆；但是，在该公司不完整的销售记录中，发现多批次成品蜂蜜的销售价格低于原料蜂蜜购入价格。该公司负责人表示，销售价低于购入价是由于商业合作等原因。检查组认为，多批次成品蜂蜜的销售价格过低，这种现象与解释不合常理。
检查人员从该公司库房随机抽取一瓶洋槐蜜，通过对产品外观色泽，产品气味以及口尝滋味等进行了初步感官品鉴，初步认定抽取的洋槐蜜无特有的洋槐花种香味，该品种疑似不是洋槐蜂蜜。该公司对此质疑没有做出合理解释。
检查发现，在该公司业务往来对账单上有川贝蜂蜜秋梨膏、甘草蜂蜜秋梨膏、儿童蜂蜜秋梨膏的销售记录。在该公司还发现有相应的未使用的产品标签。经询问企业质量负责人，该公司曾经生产过此类产品，目前已不再生产此类产品。但川贝为中药材，也不在既是食品又是药品的物品名单中。检查组认为该公司涉嫌在食品生产中添加非食品物质。
另外，该公司还存在生产环境条件、进货查验管理、从业人员管理等方面的不合规行为。