繁育简单地说就是传宗接代。是对引种和选种工作的继续和发展。只有通过正确的方式进行繁育，才能使子代蜂群最大限度地保持优良种性。在蜜蜂育种中，繁育的基本方式有单群繁育、集团繁育和闭锁繁育二种。
单群繁育是父群和母群为同一个种群的繁育方式，实际上就是兄妹交配。若累代进行单群繁育，并在每代的子代蜂群中做单群选择，所选出的若干个种性大同小异的系，就是近交系。．累代的单群繁育可使纯度提高，但生活力下降，可用若干个近交系间的杂交或混交来加以克服、
集团繁育是将若干个选出的种群分成两组，一组作父群，另一组作母群。集团繁育可同质组配，就是说母群和父群在性状表现上都有某些特色。对种性因混杂而退化的蜂群进行提纯时，最好采用同质组配；对种性因近亲繁育而退化的蜂群进行复壮，则应采用性状不同的异质组配。集团繁育一般不易造成后代生活力很快衰退，但后代纯度往往不会太高。
闭锁繁育是一种既可有效防止外来基因渗入，又可尽量延缓基因丢失的繁育方式，常用于蜜蜂保种工作。闭锁繁育只需一个种群组，种群组至少应有25 个种群组成，每个种群都需要培育种用雄蜂和处女王。其交配方式有隔离随机自然交尾和混精人工授精两种。每个世代都进行单群选择，并用母女顶替或择优选留的方法留种。